先天性弱智的原因有，遗传因素，染色体异常如先天愚型等占弱智儿童5%～10%。基因突变如先天性代谢异常病属于此类。产前损害包括宫内感染、缺氧、理化因素如有害毒物、药物、放射线、汞、铅、吸烟、饮酒、吸毒、孕妇严重营养不良或孕妇患病。分娩时产伤窒息、颅内出血、早产儿、低血唐、核黄疸等。出生后患病包括患脑膜炎、脑炎、颅外伤、脑血管意外，中毒性脑病，内分泌障碍如甲状腺功能低下，癫痫等。