一般来说，颅底凹陷症可通过手术、日常调理等方式进行治疗，具体如下：
通常情况下，颅底凹陷症是由于先天发育畸形导致，一般需进行颅凹减压、小脑扁桃体切除、颈前入路寰枢关节复位固定等手术。
在日常生活中，患者应适当运动，增强机体免疫力，多食易消化、高蛋白食物，多食富含维生素B、维生素C的食物，定时定量饮食，避免食用辛辣类食物。