胃间质瘤术后肝转移的处理办法如下：
肝转移发生后的治疗方法取决于患者具体病情，是出现同时性转移还是异时性转移。同时性肝转移，原发病变可切除，转移灶局限者，通常选择原发灶、转移灶切除手术。如肝脏转移广泛，甚至合并其他部位转移，通常需要进行活检，明确诊断后采用药物治疗以及定期进行影像学评估，如能达到根治性手术，可以考虑手术治疗，不能手术切除者，可以考虑射频消融治疗。