一般情况下，肠炎发烧当患者体温不超过38.5℃时，可用温水擦拭四肢、腋窝、腘窝、腹股沟等部位进行降温。
然后需要临床应用药物给予对症治疗。用的药物包括抗炎药物，如喹诺酮类的左氧沙星，以及头孢类的头孢他啶等。治疗期间患者要注意戒烟戒酒，不要吃辛辣、刺激、油腻的食物，以免影响药物的吸收，不利于疗效的发挥。