脑干出血恢复期的长短与脑干出血的数量和影响的程度有关，一般在3个月至6个月之间，还可能会留下比较明显的后遗症。因为脑干是中枢神经系统中最重要的器官，它涉及到人体的很多重要功能，特别是呼吸循环，所以脑干出血一般都会出现不同程度的昏迷，大部分患者会在两个星期内因为并发症而死亡。极少数患者在接受全面的治疗后，可以活下来，但是他们的身体会出现麻痹、肌肉紧张、生活质量降低、甚至是植物人的情况，需要长期的康复，可以通过高压氧、针灸、理疗、脊髓电刺激等方法来缓解。