乙脑减毒活疫苗的事故率就目前而言还比较低，但不能说根本就不是这样，因为还没有专门的数据。
但诚然，正常小儿接种乙脑减毒活疫苗有利无害，事故问题亦极少发生。如果注射了不安全的乙脑减毒活苗，那么就可能导致孩子们感染上丙型肝炎病毒，从而影响到他们以后的生活和学习，甚至还会威胁到国家和人民的生命财产安全。接种乙脑减毒活疫苗，导致意外发生的原因，主要原因仍是孩子自身有家族遗传病史，或先天疾病，因此，接种疫苗后，才能出现异常反应，对需接种乙脑减毒活疫苗者，或建议事先核对。