植物神经功能紊乱会影响人体的许多功能系统，临床症状多种多样，以患者的自觉症状为主，一般无器质性疾病。
大多数临床患者，尤其是女性患者，会出现失眠、健忘、乏力、头痛、四肢无力、头晕等症状。
如果患者已经患有慢性胃炎，自主神经功能紊乱后会频繁出现胃痛、腹胀、恶心、呕吐等胃部不适症状。
部分患者还会出现紧张、焦虑等情绪变化，肥胖患者常出现胸闷、喘不过气等症状。在无器质性疾病的情况下，上述临床表现应引起高度重视。