通常情况下，慢性肠炎不能自愈。具体情况分析如下：
慢性肠炎是指由多种因素引起的肠道黏膜的慢性炎症，患者一般表现为长期或反复发作的腹痛，肠道菌群失调后可诱发反复感染导致慢性肠炎，慢性肠炎患者如果不及时进行治疗，可能会加重患者的病情，因此慢性肠炎不能自愈。
建议慢性肠炎患者可以按照医嘱服用复方颠茄氢氧化铝片、布洛芬缓释胶囊、颠茄片等药物进行治疗。