秋季腹泻高发期可以通过以下方式治疗，具体分析如下：
1、饮食方面要注意饮食，多吃易消化的高纤维素食品，少吃油炸的食物。
2、支持对症治疗，若有腹泻，可应用思密达等肠道保护药物；止痛药，例如得舒、654-2等。
3、注意补充水分，避免因脱水而导致的相关并发症。
4、如果合并有细菌感染，应立即应用抗生素，以免病情恶化。