通常情况下，钩虫性十二指肠炎综合征是钩虫感染、胃肠道敏感等原因引起的。
钩虫感染：钩虫性十二指肠炎的主要原因是钩虫感染，病人在接触了被污染的土壤和粪便后，会通过人体的淋巴管、血液、肺部、气管等通道进入人体，一般在一周左右就会形成成虫咬附在十二指肠粘膜上。
胃肠道敏感：主要是胃肠道过敏的人，喜欢吃冷、刺激性的食物，或者有胃肠道溃疡的病人，因为胃肠道的抵抗力比较差，所以接触到易感的环境后，很有可出现钩虫性十二指肠炎综合征。