一般情况下，停经后查出患卵巢囊肿不排除恶变，具体分析如下：
如果女性已进入绝经期时，身体激素水平会发生变化，体质抵抗力就会相对降低，恶变机会就会增加。因此建议要及时检查和治疗，通常都是在卵巢囊肿上做手术，可以根据临床实际来决定术式。手术后要做好各项基础工作，并注意护理，避免进行剧烈运动，并保持积极乐观的心态。