通常情况下，小儿脑炎后遗症有肢体瘫痪、癫痫、智力低下等。具体情况分析如下：
儿童脑炎有两种情况，一种是化脓性脑炎，另一种是病毒性脑炎。化脓性脑炎的并发症有硬膜下积液，症状为化脓性脑膜炎，在治疗期间体温不升高，病程中前囟门进行性充盈；脑室管膜炎，主要表现为高烧不退，频繁抽搐，甚至是呼吸衰竭；脑积水、前囟门增大、头围逐渐增大、头皮静脉扩张等。病毒性脑炎一般在1-2个星期内痊愈，严重时会出现肢体瘫痪、癫痫、智力低下、失语、失明等后遗症。
另外，单纯疱疹病毒脑炎、乙型脑炎、肠病毒71脑炎的死亡率也较高。