一般情况下，引起儿童矮小症原因如下：
一是由于骨骼发育疾病、性早熟、骨代谢病、染色体相关疾病、生长激素缺乏症、侏儒病、先天性甲减、宫内发育迟缓引起的矮小症。第二种是短期矮小症，主要是心理因素造成的，其次是后天营养不良，蛋白质摄取不足，长期睡眠质量不能保证也会抑制生长激素分泌，从而导致矮小症，发现之后应尽早治疗。