怀孕初期肚子隐隐作痛可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果还没有做彩超，需要考虑是不是异位妊娠，受精卵在输卵管中着床，此时会受到刺激，从而导致输卵管局部的酸胀疼痛。如果通过彩超诊断为宫内孕，并且有明显的子宫局部疼痛，那么有可能是先兆流产。下腹部两侧有轻微的疼痛，可能是由于肠道痉挛、输卵管炎症、卵巢囊肿引起的。