一般情况下，肾结石合并肾萎缩比较严重。具体情况分析如下：
萎缩侧肾功能一般不会影响正常生活。肾结石合并肾萎缩的情况比较少见，主要是由于长期结石梗阻导致肾脏严重积水，肾脏皮质菲薄，解除梗阻后肾脏积水排出，肾脏体积会变小，出现这种情况是无法改变的，肾脏功能受损是不可逆的。注意保护对侧肾脏功能，定期进行泌尿系彩超、肾功能检查，及时发现新情况及时处理，以免损伤健侧肾脏功能。