一般情况下，婴儿便秘以排便次数减少，排便困难或费力，大便干结，有排便疼痛，直肠内存在大量粪便团块等症状为主要特征。
婴儿可能有消化道不适、消化功能降低的症状，因为便秘的婴儿肠道积气增多会影响婴儿的食欲，会导致婴儿腹痛、腹胀等不舒服的表现，也会引起胃肠道积气的增多，导致婴儿肛门排气增多而且很臭、频繁，除此之外便秘时间久了还会影响到婴儿的营养，导致生长发育相对落后。