一般情况下，两个月宝宝拉肚子不可以打预防针。一方面是因为两个月宝宝拉肚子期间，身体抵抗力相对低下，可能会导致打预防针后体内抗体生成受影响，进而降低免疫效果。另一方面是因为可能会加重腹泻的病情，并可能会出现其他副作用，从而对宝宝的健康不利。
一般建议待两个月宝宝拉肚子的情况改善后再打预防针，通常不会对打预防针造成不良影响。