支原体肺炎通常一周左右会缓解，两周后会好转。病情较轻的病人是可以痊愈的，无需特别的治疗。
如果是比较严重的感染，比如咳嗽、咳痰、胸痛、胸闷，或者是有其它的并发症，可以选择红霉素、阿奇霉素等大环内酯类的抗生素，也可以选择喹诺酮类的抗生素，比如左氧氟沙星等。
一般疗程需要半个月到一个多月的时间，要时刻注意观察患者的情况，避免延误治疗时间，从而降低效果。