通常情况下，药流后12天流咖啡色血是不全流产，也可能是药流后引起的宫腔感染、子宫恢复不良。具体分析如下：
药流是指用米非司酮片加米索前列醇药物口服终止早期妊娠。如果患者药流后12天流咖啡色血，可能是不全流产，也可能是药流后引起的宫腔感染、子宫恢复不良。如果宫腔里有残留物较多，必须要立即进行清宫，避免出现大流血或者宫腔内感染引起宫腔粘连。如果是少量的咖啡色分泌物，残留物较小，可以应用药物暂时保守治疗，可以口服补佳乐、新生化颗粒、桂枝茯苓丸等。