一般来说，新生儿肝炎综合征可能是以下几个原因引起的：1、病毒感染：疱疹病毒、乙肝病毒、巨细胞病毒等病毒病原体可能会诱发新生儿肝炎综合征。2、细菌感染：李司忒菌、链球菌、大肠埃希菌等细菌病原体也可导致新生儿肝炎综合征。3、新生儿肝功能障碍：新生儿肝功能障碍，如肝脏内外胆管发育不全、胆汁黏稠等，可能会导致新生儿肝炎综合征。

新生儿肝炎常见的病因：新生儿感染HBV主要有母婴垂直传播和水平传播引起。主要由病毒引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒及肠道 病毒等。弓形体原虫、李司忒菌、梅毒等，亦是本病的病因之一。母婴垂直传播具体有：(1)经胎盘传播：母亲在妊娠时感染HBV，或者是慢性HBV携带者， 均可将病毒传给胎儿。(2)经产道感染：新生儿娩出时吞入带有HBV的阴道液而被感染。(3)由母乳感染：新生儿以HBsAg阳性的母亲乳汁喂养，而被感 染。(4)生后密切接触：由于接触了感染母亲的唾液、初乳、汗液、血性分泌物，而被感染。