流感后咳嗽、头疼患者，可选用连花清瘟胶囊等对症药物进行治疗，同时配合日常生活调理缓解症状。
流感是由流感病毒引起的急性呼吸道疾病。病毒侵犯呼吸道，在气道黏膜上增殖引发炎症反应，炎性物质刺激呼吸道黏膜，出现咳嗽症状。头疼则是由于炎性物质刺激头部血管所致，或因炎症反应引起发热，导致头部血管扩张，诱发头疼。
连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫的作用，可以抑制甲型流感病毒（H1N1、H3N2等）、乙型流感病毒等多种流感病毒复制，减轻机体炎症反应，研究证实可有效缓解咳嗽、头疼、发热、鼻塞流涕、咽痛、肌肉酸痛等不适。该药为纯中药制剂，安全性良好，服用后无嗜睡等不良反应。
另外，患者在治疗期间还应注意清淡饮食，不吃辛辣刺激性的食物，以免刺激呼吸道导致咳嗽加重。