附睾炎的治疗主要侧重于缓解疼痛和清除病原体。
首先，需要卧床休息，并垫高阴囊以加速血液回流，减轻疼痛。口服止痛药如布洛芬、对乙酰氨基酚等，如果疼痛严重，可以考虑作精索封闭治疗。在明确病原体种类之前，一般根据经验用药，在明确病原体之后，可针对性用药。
常用抗生素有头孢菌素类抗生素、喹诺酮类抗生素、阿奇霉素类抗生素等。
如果附睾的炎症分泌物流出不畅，形成附睾脓肿，需要及时切开引流，再用抗生素治疗。在治疗过程中，要密切观察病情变化，并定期进行复查。同时，附睾炎患者要避免过度劳累、长期久坐等不良生活习惯，保持良好的作息，有助于病情的恢复。