附睾炎对男性的危害较大。当附睾的炎症侵犯睾丸时，可能导致睾丸感染，从而影响睾丸精子的生成及对激素的分泌。此外，附睾炎还可以侵犯睾丸或影响其血瘀，导致睾丸缺血萎缩。附睾可以储存精子和促进精子成熟。
附睾炎发作时附睾内的精子质量会出现下降，附睾炎发作时会在局部有炎性渗出，待纤维化之后可以导致附睾的管腔阻塞，从而导致精液无法从附睾内输送外出。如果双侧均患附睾炎，也都因瘢痕组织形成，导致管腔闭合，可以导致不孕不育的情况。因此，附睾炎应尽早的治疗。