在临床上，附睾炎分为急性附睾炎和慢性附睾炎。急性附睾炎的症状包括一侧阴囊迅速肿大、疼痛、寒战、高热、恶心、呕吐以及胃肠道的症状等。急性附睾炎的治疗一般是进行一般处理，如卧床休息、抬高阴囊、早期用冰敷、晚期热敷。
抗菌药物是对细菌敏感的药物，通常静脉给药一到两周后改用口服抗生素，两到四周，常使用的是头孢类、喹诺酮类、大环内酯类药物。手术治疗包括切开引流和睾丸切除手术。
慢性附睾炎的临床症状多表现不一致，症状也不明显。患者可能会有局部不适、睾丸下坠感或阴囊疼痛，疼痛也可能放射至下腹部和大腿内侧。慢性附睾炎的治疗方法包括口服广谱抗生素、局部的热敷等物理治疗。对于反复发作的患者，也可以考虑附睾切除。