附睾是睾丸精子输出和进一步成熟的部位，因此附睾炎会对男性的生育功能造成明显的障碍。附睾炎症可能导致精子成熟过程受到影响，从而出现弱精症和少精症。
对于严重的感染，如淋球菌、衣原体和结核等，附睾炎可能导致附睾和附睾管完全闭锁，从而使精子无法通过，造成附睾管梗阻，甚至引发严重的梗阻性无精症。因此，附睾炎对生育具有极大的危害。为了降低附睾炎的发生风险，应尽量避免不良生活习惯，减少感染的可能性。