珍珠状阴茎丘疹是一种非炎症性的皮肤病，通常不需要特殊治疗。当继发细菌感染或炎症较重时，可以使用莫匹罗星软膏、红霉素软膏、夫西地酸乳膏等膏药治疗。为充分发挥药膏疗效，局部涂抹药物前需要使用温水清洗局部皮肤，再将药物少量涂抹在患处。同时，建议珍珠状阴茎丘疹患者在医生指导下用药治疗，禁止自行乱用药物。
应保持局部清洁卫生，避免感染的发生。