子宫巧克力囊肿属于卵巢型子宫内膜异位症，属于典型病变类型，主要因为异位内膜在卵巢皮质内生长，形成单个或多个囊肿，称为卵巢子宫内膜异位囊肿。
另外，囊肿表面呈灰蓝色，大小不一，直径多在5cm左右，有些可增大至10-20cm。典型情况下，陈旧性血液聚集在囊内形成咖啡色黏稠液体，似巧克力样，称为卵巢巧克力囊肿。