临床上妊娠前三个月应用氟康唑单剂量或者重复给药，每天低于200mg时，不会增加对胎儿的不良影响。
如果哺乳期患者单次口服氟康唑小于200mg时，也可以继续哺乳。因此，早孕期服过低剂量的氟康唑，不要过于紧张，整个孕期会受到各种各样外来理化、生物因素的影响，都需要注意。
另外，对于复发性阴道念珠菌或者急性阴道念珠菌，可以口服氟康唑来进行治疗。氟康唑主要适用于足月新生儿、婴儿、儿童及成年人，还有隐球菌性脑膜炎、球孢子菌病的患者。