通常所指的是生殖器官，而上厕所时，生殖器疼痛可能是由于膀胱炎或尿道炎等因素所导致。
1、膀胱炎。膀胱炎性病变所致的症状包括尿频、尿急、尿痛等，女性因其生理结构而比男性更容易出现膀胱炎，因为女性的尿道长度较男性更短，更容易受到感染，如果疼痛程度不是特别严重，只要在日常生活中多喝一些水，通常可以缓解，同时也可以在医生的指导下使用抗生素药物进行治疗，如氧氟沙星、头孢菌素等。
2、尿道炎的发生。由于淋球菌或非淋球菌引起的尿道炎症，导致患者出现尿频、尿痛、尿道刺痒等症状，这些症状通常通过性接触传播，医生可以指导使用阿奇霉素、头孢曲松、大环内酯类、四环素类药物进行治疗。