宫外孕不能行药物流产。宫外孕也叫异位妊娠，指的是受精卵着床在子宫体腔以外的部位。药物流产只适用于妊娠小于49天以内的子宫内妊娠。宫外孕临床上最常见的就是输卵管妊娠，输卵管妊娠的治疗有药物治疗和手术治疗，药物治疗主要是应用化学药物杀死胚胎。目前临床应用的药物是甲氨蝶呤，甲氨蝶呤能抑制滋养细胞增生，破坏绒毛，使胚胎组织坏死、脱落及吸收。