扁桃体结石，若无症状，不需治疗，可向患者进行解释，以释其疑虑，同时改善其全身健康情况，希望能自愈。一般治疗无效时，可考虑拔除角化栓，并以电烙术灼其附着处，使其结痂。目前多采用激光或冷冻方法代替电烙术。若病变仅局限于腭扁桃体范围，自觉症状又较重者或扁桃体成为炎性病灶，可施行扁桃体切除术。另外口腔疾病需予以治疗。