输尿管结石发烧的主要原因是由于输尿管结石嵌顿在输尿管内，引起尿液引流不畅，从而使得结石以上的输尿管和肾盂肾盏压力增大。这种情况下，引流不畅的尿液内会出现细菌感染，细菌在压力的作用下进入到血液系统，从而形成菌血症。菌血症会导致患者发热，特别是在病程后期，病情会逐渐恶化，演变为尿脓毒血症，出现感染性休克的表现，甚至威胁患者的生命。因此，及时诊断和治疗输尿管结石发烧是非常重要的。