穿心莲有清热解毒，凉血消肿，燥湿的作用。可用于风热感冒，温病初起，发热头痛，可与金银花、连翘、薄荷等同用。咽喉肿痛，口舌生疮，多与牛蒡子、板蓝根、玄参等同用。肺痈咳吐脓血，可配伍桔梗、冬瓜仁、鱼腥草。痈肿疮疡，蛇虫咬伤。胃肠湿热所致的泄泻、痢疾。小便淋沥涩痛。本品味甚苦，入煎剂易致恶心呕吐，故临床多作丸、片剂服用。