3个月的宝宝眼屎很多有以下几种原因：一、宝宝上火，比如宝宝穿的过多或包裹的太厚、室温过高、母乳喂养的妈妈吃辛辣刺激性食物，都可以引起宝宝上火，导致宝宝眼屎多。可以给宝宝多喂点水，适当用点清火药。二、眼部炎症，如结膜炎、泪腺堵塞等，需要去医院眼科进行相关检查，对症治疗。宝宝有眼屎，不要直接用手擦眼屎，可以用棉签轻轻擦拭。