小儿肠套叠的治疗方法包括灌肠、手术治疗，发生肠套叠后应及时到专科医院就诊，建议到儿童专科医院，肠套叠灌肠的治疗方法包括空气灌肠、水灌肠。
空气灌肠前后需要拍片子明确是否复位，有辐射，但一般问题不大。水灌肠没有辐射，是在超声下监测，能很直观的看到肠套叠有没有复位。另外水灌肠因为是在超声下灌肠，对于反复肠套叠、肠息肉、梅克尔憩室等有一定的诊断价值。