小儿卡斯钦-贝克病目前尚无有效治疗方法，主要对症治疗减轻疼痛，抗氧化和补硒等对症支持治疗，有明显关节畸形者可进行手术治疗，如有肌肉痉挛疼痛者可以使用超声波、水疗等方法缓解。
一、药物治疗
1、亚硒酸钠：亚硒酸钠和维生素E等抗氧化类药物可以去除体内自由基，缓解病情进展，减少并发症发生。
2、硫酸软骨素钠：硫酸软骨素钠对软骨基质中硫酸软骨素的形成起重要作用，该药物在临床上可应用于缓解关节疼痛，僵硬等症状，有利于关节功能的恢复。
3、阿司匹林：常用阿司匹林或其他水杨酸制剂等非甾体抗炎药，不仅可用于止痛，还能抑制蛋白水解酶，促进软骨病变修复。
4、硒盐制剂：常用硒盐、硒片等，可补充体内缺乏的微量元素硒，延迟病情发展。
5、透明质酸钠：关节内注射用药，通过润滑关节，改善关节活动功能。
6、双歧杆菌或乳酸杆菌：双歧杆菌或乳酸杆菌等微生态制剂，可恢复肠道微生态平衡，重建患儿肠道天然屏障，促进患儿康复。
二、手术治疗
1、手术矫形术：晚期重症关节畸形者可酌情采用手术矫正，改善关节功能。
2、摘除游离体：当出现摩擦骨或引起关节绞锁与剧痛时可将关节腔内的游离体切除，例如膝关节腔内的小骨块等，可缓解症状，恢复关节功能，可采用关节镜下关节清理，术中防治污染。
3、切除赘生物：因骨唇过多过大而影响关节活动者可将骨唇切除以改善功能。
4、关节置换：晚期重症关节畸形且功能障碍，严重影响生活质量者可考虑关节置换，手术过程中保持清洁，以防污染。
三、物理治疗
包括超短波、超声波、水疗、蜡疗、泥疗、红外线治疗等，可以缓解疼痛和肌痉挛，主要使用适用于肌肉挛缩、关节疼痛和运动障碍者。可促进局部血液循环，解除局部肌肉痉挛，减轻疼痛，增强机体免疫功能，促进疾病自然愈合等。