如果不及时治疗，可能会有以下危害。囊肿破裂危及生命，当巧克力囊肿生长到一定大小，有可能出现并发症，比如感染、囊肿蒂扭转、出血或破裂等，均能危及女性的生命。另外，囊肿在早孕时可能会引起流产，中期妊娠时可能发生囊肿蒂扭转，孕晚期可能会导致胎位异常。分娩时可能会阻塞产道，引起难产。因此巧克力囊肿及时去正规医院的妇科进行检查、治疗，以免延误病情，危害身体健康。