阴囊萎缩可能是生理性因素引起的，有可能是由于阴囊受损、隐睾等引起。
1.生理性因素：阴囊一般是用来盛放睾丸和附睾等脏器的囊袋，它的弹性很大，收缩性也很好，当遇到寒冷或性刺激时，就会出现平滑肌的收缩，从而使其变得很小。
2.阴囊受损：由于受到了烧伤、刺伤、碰撞等外部损伤，导致了阴囊组织的损伤，在创伤的恢复期间，由于局部组织的疤痕，导致了阴囊的收缩。
3.隐睾：睾丸可能是由于睾丸牵引带异常，精索血管发育异常，睾丸体积太大，导致睾丸不能向阴囊，导致阴囊缩小。