检测幽门螺杆菌的碳13和碳14呼气试验都要求病人要空腹，最好是早晨不吃饭、不喝水时就去做检查，如果有些病人已经进食了，也可以在进食后两小时再来做检查。
做呼气试验时还要注意有一些药物也可能会引起幽门螺杆菌试验的假阴性结果，如质子泵抑制剂，有奥美拉唑、艾普拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、艾司奥美拉唑等，这些药物一般要停用2-4周才会不影响检查的结果，还有一些抗生素类药物和胃黏膜保护剂也会影响碳13和碳14的呼气试验结果。