尿液当中鳞状上皮细胞增高，很有可能是存在慢性膀胱黏膜炎症或者是肾盂肾炎导致，最好能够进一步的检查尿培养，明确致病微生物的种类和药物敏感性以后，再针对性的治疗，也可以通过膀胱镜的病理学检查明确诊断。
一般先选择敏感的抗生素，比如呋喃妥因片、磺胺嘧啶片，持续的治疗一段时间，清除致病微生物以后，尿液当中的鳞状上皮细胞会慢慢减少。如果口服药物治疗效果不好，也可以通过经尿道膀胱颈电切手术切除病变黏膜，也会有效果。