沙眼衣原体感染主要是由沙眼包涵体性结膜炎、泌尿生殖道感染、性病淋巴肉芽肿等感染所致。最普遍的是沙眼症。沙眼是沙眼衣原菌株abbac的亚型所致，其传染途径为：直接或间接的暴露。沙眼衣原体侵染眼球结膜后，在结膜上皮中增生，并在胞质中形成散在性毛型、桑葚型或甜味型的囊泡，初期可发生亚急性、慢性的眼部结膜炎，以流泪、粘液脓性分泌物、结膜充血等为特征。到了晚期，会发展为长期的，形成疤痕、眼球内翻、倒睫、角膜血管瘤等，从而造成角膜的损伤，从而造成视力下降，最终造成失明。