眼角长期出现水疱，可能的原因有：
1.单纯疱疹病毒感染，由于免疫力降低导致，可出现局部长水疱并伴有疼痛。治疗方法为使用抗病毒药物滴眼液，并注意眼睛卫生。
2.睑板腺管堵塞，导致腺管内脂质液体积聚而形成水疱，可伴有局部皮肤红肿和瘙痒。可以热敷，也可以用抗生素眼药水。必要时可以接受睑缘清创术。
3.过敏性结膜炎，由过敏原刺激引起，可出现流泪、畏光等症状。建议远离过敏原，并根据医生处方用抗组胺药物治疗。
此外，恶性肿瘤等其他疾病也可能导致眼角水疱。建议尽快进行体格检查、眼科检查明确诊断，然后积极配合医生治疗。