游泳后眼睛疼的原因可能有以下几种：
1.受外物刺激。可以用生理盐水冲洗眼睛，一般能得到改善。
2.细菌性结膜炎。可以在医生指导下，使用抗生素类眼药水，如妥布霉素地塞米松滴眼液，治疗炎症。
3.过敏性结膜炎。可以在医生指导下，使用抗组胺类眼药水，如吡嘧司特钾滴眼液，以及口服抗组胺药物，如西替利嗪，治疗过敏反应。
4.治疗期间要注意休息眼睛，减少用眼，饮食以清淡为主。遵医嘱用药，必要时进行复诊。如果症状严重或持续反复发作，应及时就医进一步检查治疗。