手术的主要方法是脑神经核毁损术和脑深部电刺激术。手术并不能治好帕金森病，而是仅仅能改善症状，术后仍然需要使用药物，但可以相应的减少剂量，而且手术必须严格掌握适应症。手术对震颤和肌肉强直有较好的效果，对步态障碍没有明显改善效果。后者相对安全，可以微创操作，并且具有后期的可调控性，故目前作为主要的手术方式。