小孩有点头疼的原因有先天性脑发育异常、急性感染性疾病的前驱症状等，具体分析如下:
1.先天性脑发育异常：小孩有点头疼可能是先天性脑血管畸形、颅脑占位性病变等先天性脑发育异常所致，需要及时就医诊治。
2.急性感染性疾病的前驱症状：小孩有点头疼的情况较最为常见，可能是急性感染性疾病的前驱症状，此类疾病容易导致发热，引起头疼，多见于病毒性感冒、肺炎、急性支气管炎、病毒性脑炎等疾病。