一般情况下，怀孕40天做人工流产手术，一般是比较疼的。人工流产手术的方式一般有药物流产和负压吸引术。药物流产这主要是采用药物的方法将妊娠物排出，临床常用的药物一般有米非司酮和米索前列醇，大多数女性在服用米非司酮后，容易出现轻微的恶心、呕吐的症状，一般极少数的患者会出现少量的阴道流血，一般在服完米索前列醇后可能出现腹痛的症状，这种腹痛一般不是很严重，大多数在6小时以内，孕囊都会完整排出，负压吸引术主要是利用负压吸引的原理将妊娠物从宫腔吸出，这种手术一般不是特别疼痛，绝大多数的女性都能够忍受。