甲减出现后，终生口服甲状腺激素制剂治疗。主要有干甲状腺片、左甲状腺片两种。
干甲状腺片是动物干制剂，由于其中甲状腺激素含量不稳定且T3含量过高，目前普遍采用的是左甲状腺片，而不是干甲状腺片。一般早晨空腹口服，少量定期复查甲功，根据甲状腺激素水平逐渐调整剂量，直到血液中甲状腺激素和促甲状腺激素调整到正常范围内。正规治疗后，患者一般预后较好，可长期生存，不影响甲减患者的工作、生活和生育，但维持治疗期限须每半年复查甲状腺功能。