乙肝大三阳最好不要做羊水穿刺。
羊水穿刺在做的时候最好是在健康状态下，有乙肝大三阳应该避免做。羊水穿刺主要使用无菌针头进入到女性的宫腔内，抽取羊水来进行化验，如果本身存在有乙肝大三阳在做羊水穿刺的时候有可能会将病毒引入到宫腔内导致宫内感染，对于腹中胎儿会产生不良。
在做羊水穿刺之前本身有特殊情况可以咨询专业医生，会根据患者实际情况给予合适的检查方式，尽量保证胎儿和孕妇安全。