新生儿结肠炎根据病因、病情轻重程度及患儿体质不同，恢复时间略有差异。
结肠炎是由各种原因引起的肠道炎症性病变，根据病因不同可分为细菌性结肠炎、溃疡性结肠炎、肠结核、缺血性结肠炎等。病因不同，治疗方法也有所不同。细菌行结肠炎只需要进行抗菌治疗，一般一周就能恢复。溃疡性结肠炎病情容易反复发作，治疗长期长，时间可长达数月甚至数年。肠结核要进行抗结核治疗，治疗周期在半年以上。缺血行肠炎只要是针对缺血性病因进行治疗，恢复期在2-4周。慢性结肠炎不及时会出现很多并发症，影响健康，甚至危及生命。
建议如果出现结肠炎的表现，如腹痛、腹泻、发热、消瘦、便血等，及时就医。