扁平疣的根治方法是激光或者冷冻。
激光主要是通过射线照射阻断扁平疣与皮肤的粘连处，达到治疗扁平疣的效果。扁平疣是由于HPV病毒感染所引发的，这属于一种传染性疾病，在密切接触到带有病毒的患者之后，就有可能导致被感染，而且该疾病可能会出现反复发作，所以要做好隔离和防护措施。
在治疗期间要尽量避免对患处进行抓挠，以免导致扁平疣破损之后引起病毒感染，同时要注意患处的卫生和清洁，可用温开水清洗患处。